Комплекс горы Воттоваара объявлен ландшафтным памятником природы. Соответствующее постановление было издано правительством республики. Охраняемая территория занимает площадь более полутора тысяч гектаров: в неё входит сама гора и прилегающая к ней местность.
Попытки придать статус памятника самой высокой точке Западно-Карельской возвышенности были предприняты несколько лет назад. В последнее время облик горы стал сильно меняться из-за массового, нерегулируемого потока туристов, здесь нередко происходят пожары, устраиваются джип-туры.
В ответ на обращения местных жителей в 2008 году в Муезерский район была отправлена научно-исследовательская экспедиция. Учёные Карельского научного центра Российской академии наук пришли к выводу, что Воттоваара действительно представляет собой ценность. В этом уникальном уголке природы сохранились самые южные в Европе лесотундровые леса. Также на горе отчётливо видны последствия ледниковых процессов, проходивших в этих местах около десяти тысяч лет назад.
Теперь на территории памятника природы запрещена любая деятельность, которая может нанести ему вред. Контроль за соблюдением охранного режима будет осуществлять министерство по природопользованию и экологии Карелии.
