Во второй части новой версии "Черепашек-ниндзя" главные герои столкнутся со своим старым врагом - Шраддером. Он намерен раздавить мутировавших животных раз и навсегда, для этого из своих подопечных он создаёт таких же мутантов - носорога и кабана.